Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MLH3Q9UHC1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MLH3Q9UHC1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms