Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO40Q9UH90 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO40Q9UH90 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO40Q9UH90 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms