Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms