Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP9

GULP1, PTB domain-containing engulfment adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GULP1Q9UBP9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GULP1Q9UBP9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GULP1Q9UBP9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms