Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCD2Q9UBJ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCD2Q9UBJ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCD2Q9UBJ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD2Q9UBJ2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD2Q9UBJ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD2Q9UBJ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD2Q9UBJ2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD2Q9UBJ2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD2Q9UBJ2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms