Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAE1Q9UBE0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAE1Q9UBE0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAE1Q9UBE0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms