Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHPF2Q9P2E5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHPF2Q9P2E5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHPF2Q9P2E5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms