Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MBD5Q9P267 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
MBD5Q9P267 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MBD5Q9P267 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
MBD5Q9P267 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
MBD5Q9P267 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
MBD5Q9P267 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MBD5Q9P267 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MBD5Q9P267 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
MBD5Q9P267 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
MBD5Q9P267 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms