Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCMF1Q9P0J7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCMF1Q9P0J7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms