Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms