Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ0

DNAJC27, DnaJ homolog subfamily C member 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC27Q9NZQ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DNAJC27Q9NZQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJC27Q9NZQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms