Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC43.21■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC43.2■■■■■ 4.51
BICRAQ9NZM4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC43.18■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
BICRAQ9NZM4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC43.09■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC43.09■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
BICRAQ9NZM4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms