Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MYOFQ9NZM1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYOFQ9NZM1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms