Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKIRAS1Q9NYS0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKIRAS1Q9NYS0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms