Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED29Q9NX70 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED29Q9NX70 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms