Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB20Q9NX57 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB20Q9NX57 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms