Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COMMD8Q9NX08 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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