Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAMSN1Q9NSI8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAMSN1Q9NSI8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms