Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SALL1Q9NSC2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SALL1Q9NSC2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SALL1Q9NSC2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms