Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE3Q9NRF9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLE3Q9NRF9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms