Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST12Q9NRB3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST12Q9NRB3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST12Q9NRB3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms