Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF4Q9NR80 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF4Q9NR80 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF4Q9NR80 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF4Q9NR80 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF4Q9NR80 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF4Q9NR80 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF4Q9NR80 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF4Q9NR80 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF4Q9NR80 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF4Q9NR80 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF4Q9NR80 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARHGEF4Q9NR80 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF4Q9NR80 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF4Q9NR80 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms