Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM10Q9NQV6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM10Q9NQV6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM10Q9NQV6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM10Q9NQV6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRDM10Q9NQV6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms