Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
INCENPQ9NQS7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms