Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX9Q9NQ69 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX9Q9NQ69 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX9Q9NQ69 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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