Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED4Q9NPJ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms