Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A4GALTQ9NPC4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms