Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PARD6AQ9NPB6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARD6AQ9NPB6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms