Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD4Q9HCU8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLD4Q9HCU8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms