Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM8AQ9HCN3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms