Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIAA1549Q9HCM3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KIAA1549Q9HCM3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms