Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
USP29Q9HBJ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP29Q9HBJ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms