Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LY9Q9HBG7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LY9Q9HBG7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms