Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC52A2Q9HAB3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC52A2Q9HAB3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC52A2Q9HAB3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC52A2Q9HAB3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC52A2Q9HAB3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC52A2Q9HAB3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC52A2Q9HAB3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC52A2Q9HAB3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC52A2Q9HAB3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC52A2Q9HAB3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC52A2Q9HAB3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC52A2Q9HAB3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC52A2Q9HAB3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms