Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVMER34-1Q9H9K5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVMER34-1Q9H9K5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms