Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CATSPERBQ9H7T0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CATSPERBQ9H7T0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATSPERBQ9H7T0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms