Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAS3Q9H6U6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BCAS3Q9H6U6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCAS3Q9H6U6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms