Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC134Q9H6E4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC134Q9H6E4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms