Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC68Q9H2F9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC68Q9H2F9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms