Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM49AQ9H0Q0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM49AQ9H0Q0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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