Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 RCC1-207ENST00000427469 903 ntTSL 512.24□□□□□ -0.454e-55■■■■□ 25.9
CSTF2TQ9H0L4 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.714e-55■■■■□ 25.9
CSTF2TQ9H0L4 SNHG3-202ENST00000437681 2614 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.724e-55■■■■□ 25.9
CSTF2TQ9H0L4 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.864e-55■■■■□ 25.9
CSTF2TQ9H0L4 SNHG3-201ENST00000413987 2201 ntTSL 1 (best)8.95□□□□□ -0.984e-55■■■■□ 25.9
CSTF2TQ9H0L4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.583e-9■■■■□ 25.9
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-218ENST00000441124 708 ntTSL 217.8■□□□□ 0.443e-10■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-217ENST00000430918 612 ntTSL 39.7□□□□□ -0.863e-10■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-219ENST00000442714 569 ntTSL 49.62□□□□□ -0.873e-10■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 EIF4A1-219ENST00000581770 447 ntTSL 213.19□□□□□ -0.33e-11■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.938e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.918e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.344e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.756e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.476e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.056e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.26e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-215ENST00000495130 744 ntTSL 311.67□□□□□ -0.546e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-211ENST00000471315 319 ntTSL 310.64□□□□□ -0.716e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.426e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.783e-12■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.053e-12■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 514.95□□□□□ -0.023e-12■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NAMPT-205ENST00000424768 1147 ntTSL 411.29□□□□□ -0.68e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NAMPT-203ENST00000393618 592 ntTSL 410.89□□□□□ -0.678e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.78e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NAMPT-213ENST00000491027 1009 ntTSL 210.22□□□□□ -0.778e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NAMPT-206ENST00000441045 589 ntTSL 49.86□□□□□ -0.838e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NAMPT-204ENST00000417537 300 ntTSL 48.21□□□□□ -1.18e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NAMPT-210ENST00000486949 1115 ntTSL 27.95□□□□□ -1.148e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NAMPT-212ENST00000489732 1976 ntTSL 26.81□□□□□ -1.328e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NAMPT-211ENST00000489358 581 ntTSL 36.59□□□□□ -1.358e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.538e-8■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.453e-9■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 CNN2-212ENST00000607102 307 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.052e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 CNN2-210ENST00000569352 731 ntTSL 513.75□□□□□ -0.212e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 CNN2-204ENST00000562075 623 ntTSL 1 (best)12.89□□□□□ -0.352e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 CNN2-211ENST00000606983 537 ntTSL 310.38□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.135e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 TAF15-201ENST00000603067 580 ntTSL 57.88□□□□□ -1.155e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.681e-16■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.761e-16■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 NKTR-202ENST00000429888 7325 ntTSL 53.84□□□□□ -1.81e-16■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 POFUT2-209ENST00000476653 598 ntTSL 217.43■□□□□ 0.387e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 515.46■□□□□ 0.073e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 POFUT2-212ENST00000493811 577 ntTSL 313.82□□□□□ -0.27e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 POFUT2-211ENST00000493524 890 ntTSL 513.64□□□□□ -0.237e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 POFUT2-207ENST00000468360 757 ntTSL 512.33□□□□□ -0.447e-7■■■■□ 25.8
CSTF2TQ9H0L4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.257e-10■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.077e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 TRAF2-205ENST00000466107 233 ntTSL 310.21□□□□□ -0.775e-8■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 MAFG-203ENST00000574686 570 ntTSL 521.16■□□□□ 0.988e-8■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.893e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 519■□□□□ 0.633e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.463e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.135e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PAX8-AS1-206ENST00000445745 2570 ntTSL 1 (best)13.75□□□□□ -0.215e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.222e-9■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.798e-10■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.288e-10■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PPP1CC-211ENST00000620030 582 ntTSL 222.16■■□□□ 1.148e-10■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.048e-10■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PPP1CC-209ENST00000551690 603 ntTSL 320.44■□□□□ 0.868e-10■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 TACC1-212ENST00000521050 491 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.145e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 TACC1-216ENST00000521642 493 ntTSL 1 (best)15.25■□□□□ 0.035e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 TACC1-222ENST00000522752 944 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.365e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.525e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 TACC1-223ENST00000522904 1724 ntTSL 511.49□□□□□ -0.575e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 TACC1-204ENST00000518415 3011 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.875e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.055e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.055e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 DSCR10-201ENST00000432141 860 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.15e-8■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.039e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.459e-7■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PRMT1-204ENST00000525616 780 ntTSL 220.82■□□□□ 0.929e-8■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PRMT1-220ENST00000534676 915 ntTSL 217.93■□□□□ 0.469e-8■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PRMT1-218ENST00000534280 766 ntTSL 317.57■□□□□ 0.49e-8■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PRMT1-203ENST00000524771 713 ntTSL 315.3■□□□□ 0.049e-8■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PRMT1-207ENST00000527382 699 ntTSL 312.05□□□□□ -0.489e-8■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PRMT1-219ENST00000534465 779 ntTSL 312.05□□□□□ -0.489e-8■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PRMT1-211ENST00000528623 543 ntTSL 311.84□□□□□ -0.519e-8■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PRMT1-212ENST00000529284 1182 ntTSL 510.66□□□□□ -0.79e-8■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 PRMT1-205ENST00000525915 298 ntTSL 34.29□□□□□ -1.729e-8■■■■□ 25.7
CSTF2TQ9H0L4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.624e-7■■■■□ 25.6
CSTF2TQ9H0L4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.161e-8■■■■□ 25.6
CSTF2TQ9H0L4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.871e-8■■■■□ 25.6
CSTF2TQ9H0L4 HAGHL-214ENST00000567414 735 ntTSL 218.96■□□□□ 0.631e-8■■■■□ 25.6
CSTF2TQ9H0L4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.551e-8■■■■□ 25.6
CSTF2TQ9H0L4 HAGHL-207ENST00000561750 675 ntTSL 218.46■□□□□ 0.551e-8■■■■□ 25.6
CSTF2TQ9H0L4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.381e-8■■■■□ 25.6
CSTF2TQ9H0L4 MTHFD1L-206ENST00000423867 524 ntTSL 216.99■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 25.6
CSTF2TQ9H0L4 EXD3-212ENST00000491734 2176 ntTSL 1 (best)16.82■□□□□ 0.281e-7■■■■□ 25.6
CSTF2TQ9H0L4 DTX2-220ENST00000479915 1752 ntTSL 216.2■□□□□ 0.181e-7■■■■□ 25.6
CSTF2TQ9H0L4 HAGHL-208ENST00000562141 650 ntTSL 516.13■□□□□ 0.171e-8■■■■□ 25.6
CSTF2TQ9H0L4 EXD3-210ENST00000487745 1992 ntTSL 215.95■□□□□ 0.141e-7■■■■□ 25.6
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