Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MKRN2Q9H000 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms