Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COMMD5Q9GZQ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COMMD5Q9GZQ3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COMMD5Q9GZQ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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