Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms