Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LNPKQ9C0E8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LNPKQ9C0E8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms