Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZC3H12CQ9C0D7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12CQ9C0D7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms