Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF518BQ9C0D4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF518BQ9C0D4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF518BQ9C0D4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF518BQ9C0D4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF518BQ9C0D4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF518BQ9C0D4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF518BQ9C0D4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF518BQ9C0D4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF518BQ9C0D4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF518BQ9C0D4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF518BQ9C0D4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms