Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZCCHC2Q9C0B9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms