Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTNAP4Q9C0A0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP4Q9C0A0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms