Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms